阿拉善双峰驼是世界主要骆驼品种之一，是宝贵的骆驼种质资源。阿拉善双峰驼主要分布在内蒙古阿拉善、鄂尔多斯、巴彦淖尔和甘肃、宁夏等地，经过长期的自然选择和人工选育，阿拉善双峰驼除具有较强的抗逆特性外，还是当地乳、肉、绒兼用型经济家畜。其中，乳用性能是阿拉善双峰驼重要的经济性状。驼乳与其他乳类相比，具有更加丰富的营养物质和生物活性因子，对人类健康、疾病预防及治疗具有重要作用。
近日，阿拉善盟畜牧研究所道勒玛老师联合内蒙古农业大学动物科学学院和生命科学学院联合培养博士生郭丽丽以及北京康普森农业科技有限公司，共同完成了“驼铃一号”双峰驼1k功能位点液相育种芯片的研发。该芯片的研发为阿拉善乳用驼选育提供了更高效的新工具，填补了阿拉善双峰驼乳用性能育种芯片的空白。
图1国内首款骆驼功能芯片“驼铃一号”
本研究基于来自我国中西部地区几个主要的阿拉善双峰驼养殖区的近千峰泌乳期双峰驼样本，通过对其中具有代表性的双峰驼样本进行基因组和转录组数据的分析，结合多个关键产乳性状（乳产量、乳蛋白含量、乳脂含量、乳糖含量等），鉴定显著相关的SNP位点，同时添加已报道的产奶性状功能基因相关位点，采用康普森CAGT?靶向捕获测序技术，最终设计完成此包含个SNP位点的靶向捕获芯片。
适合于产乳性状研究
本芯片包含阿拉善双峰驼产乳性状个位点，其中与乳产量相关的位点个，与乳蛋白含量相关的位点个、乳糖含量相关的位点个、乳脂含量相关的位点个等。大多数位点位于基因body区，位点与功能直接相关。
图2阿拉善双峰驼产乳性状的功能位点
灵活性高
基于探针杂交靶向捕获测序技术，可根据需求增加标记位点，进一步扩展产品的应用场景。
性价比高
基于国产化设计、检测和分析流程，大大降低分型成本；采用自动化检测流程，提升检测通量和稳定性。
利用“驼铃一号”对24个样品进行捕获测序和分型，其中包含3对重复样本，以评估芯片检测性能。
基因组比对率
所有样本基因组比对率均在99%以上，平均比对率为99.77%。
图3测试样本的基因组比对率
重复样本分型一致性
3个重复样本分别进行检测，每对重复样本的分型一致性均为%，展现了本芯片检测的稳定性。
图4测试样本重复样本分型一致性
位点检出率
对所有测试样本的检出率进行统计，在目标位点覆盖深度大于5×的情况，平均位点检出率为99.72%，即便当标位点覆盖深度大于20×时，平均位点检出率仍高达99.07%，表明本芯片设计合理，位点检出率高。
图5测试样本的位点检出率
本芯片是专为产乳性状设计开发的功能芯片，可用于阿拉善双峰驼产乳性状的分子标记辅助育种以及全基因组选择；亦可用于群体遗传分析、基因组育种值估计、亲缘关系鉴定、泌乳功能基因组研究等相关生产和科研领域。
